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Táxons de zooplâncton
O zooplâncton é constituído por uma grande riqueza de espécies em ambientes dulcíolas,sendo constituído por diferentes tipos de invertebrados. Dentre os principais podemos citar os Rotíferas, que organismos diversificados em sua forma estrutural, sua maioria é livre natante, porém há sésseis e parasitas. Eles habitam os mais variados corpos de água, sendo em sua maioria de água doce. São conhecidos como os menores metazoários e se alimentam de algas,detritos,bactérias podendo ser assim filtradores. Já os cladóceros são crustáceos da ordem Cladocera que vivem em água doce em sua maioria e possuem hábito rastejador ou sendo bentônicos em regiões litorâneas de lagos e reservatórios (sendo notável sua presença em lugares em que há presença de macrófitas. Em pesquisas recentes foi comprovado que sua riqueza e diversidade é maior em locais com comparecimento dessas plantas aquáticas).Eles também são ótimos indicadores de condições ambientais e são utilizados para estudos ecotoxicológico.
A classe Copepoda é a mais diversificada entre os crustáceos. Há 12.000 spp conhecidas em que 1.200 são próprias de águas continentais. São considerados um grupo de organismos pluricelulares mais abundantes no planeta, habitando os mais diversos ambientes, incluindo terras úmidas.Os copépodes de água doce podem ser diferenciados de invertebrados aquáticos por meio de características morfológicas,em que seu corpo possui segmento cilíndrico e apêndices numerosos segmentados na cabeça e no tórax e ramos caudais na extremidade do seu abdômen. Sua apomorfina é estrutura em suas pernas nadadoras conectado em sua base por um acoplado ou esclerito intercoxal.

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