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Microbiota Bucal Residente
Bactérias
Acholeplasma
Acholeplasma laidlawii: microbiota bucal humana. Parasita outros invertebrados.
Actinobacillus - Presentes em microbiota de seres humanos, mamíferos e aves.
Actinobacillus actinomycetemcomitans: hábitat é o sulco gengival humano, porém coloniza também mucosas da boca e orofaringe. Apresentam envolvimento em periodontite agressiva. O LPS de Actinobacillus 
Actinomyces - Correlacionados com gengivite e cárie dentária radicular.
Actinomyces israelli: principais agentes da actinomicose, encontrados no biofilme dentário. Na região cervicofacial,o microorganismo penetra o tecido por uma área lesionada, como gengiva inflamada, dentes desvitalizados, alvéolo dentário ou amígdalas infectados.
Actinomyces naeslundii: presente em biofilme dentário; causam lesões actinomicóticas. Possuem mecanismos de aderência ao dente.
Actinomyces odontolyticus: hábitat é o dorso da língua, biofilme e cálculo dentário.
Actinomyces viscosus: biofilme e cálculo dentário, ocasionalmente isolados de lesões actinomicóticas.
Actinomyces meyeri: sulco gengival.	
Arachina 
Arachnia propionica: habitantes da cavidade bucal humana, ocasionalmente causam lesões semelhantes às actinomicóticas. 
Bacteroides - isolados de sulco gengival humano, trato intestinal de humanos e animais.
Bacteroides forsythus: apresentam extremidades afiladas. Correlacionado com doença periodontal humana.
Bacteroides heparinolyticus: hábitat é microbiota bucal humana.
Bifidobacterium - presente em biofilme dentário humano.
Bafidobacterium dentium: isolados de biofilme dentário humano.
Branhamella
Banhamella catarrhalis: hábitat é a língua, saliva e mucosa bucal. 
Camplylobacter - encontrados em aparelho reprodutor, trato gastrointestinal e cavidade bucal humanos e animais.
Camplylobacter concisus: sulco gengival de pacientes com gengivite e periodontite juvenil localizada.
Camplylobacter curvus: isolado de canal radicular e abcesso dentário.
Camplylobacter rectus: encontrado em sulco gengival, infecção endodontica e bolsa periodontal.
Camplybacter sputorum subsp. Sputorum: sulco gengival. Associada a infecção endodontica.
bucal humana.
Eikennela 
Eikennela corredens: habitante da boca e intestino humano, podendo ser patógeno oportunista. Isolado de periodontites e de infecções endodônticas. 
Eubacterium – considerados periodontopatógenos importantes.
Eubacterium alactolyticum: presente no cálculo dentário, sulco gengival em casos de doença periodontal, canais radiculares e abcessos. 
Eubacterium brachy: microbiota subgengival.
Eubacterium nodatum: microbiota subgengival.
Eubacterium timidum: raspados supra e subgengival de dentes de indivíduos com doença periodontal.
Eubacterium saburreum: biofilme dentário e sulco gengival.
Eubacterium ventriosum: isolados de abcesso.
Eubacterium yuri: microbiota subgengival e biofilme dentário humano.
Fusobacterium – encontrados no sulco gengival e trato intestinal, genital e respiratório humano. Podem causar lesões purulentas graves em vários tecidos humanos e de animais. Apresentam importante papel na formação do biofilme dentário, atuando como agente de união entre colonizadores iniciais e tardios.
Fusobacterium alocis: isolado de sulco gengival e bolsas periodontais humanas.
Fusobaterium necrophorum: habitante da cavidade bucal humana, podendo causar lesões na boca.
Fusobacterium nucleatum: hábitat principal é a gengiva marginal e o sulco gengival. Correlacionados com casos de gengivite e periodontite. 
Fusobacterium periodonticum: hábitat é o sulco gengival, porém não correlacionado com doença.
Fusobacterium sulci: isolado de bolsas periodontais.
Gemella – habitantes de cavidade bucal, intestino e trato respiratório de humanos.
Gemella haemolysans: habitante de cavidade bucal humana, não correlacionados com doença.
Gemella morbillorum: habitante na cavidade bucal humana, não correlacionados com doença.
Haemophilus (que gosta de sangue)
Haemophilus aphrophilus: isolados do biofilme dentário e de bolsas periodontais.
Haemophilus parahaemolyticus: hábitat é cavidade bucal e faringe. Isolados de faringites, endocardites e infecções bucais.
Haemophilus parainfluenzae: espécie mais frequente na boca.
Haemophilus paraphrophilus: isolado de biofilme dentário.
Lactobacillus – encontrados na cavidade bucal humana, correlacionados com progressão de lesões de cárie e alta ingestão de sacarose. 
Lactobacillus celobiousus: correlacionado com etiologia da cárie dentária.
Lactobacillus oris: isolado da saliva humana.
Lactobacillus rimae: isolada de sulco gengival humano.
Lactobacillus uli: isolado do sulco gengival humano, correlacionado com etiologia da cárie humana.
Leptotrichia
Leptotrichia buccalis: hábitat é a cavidade bucal humana, mas também podem ocorrer na região periuretral feminina e boca de cobaias.
Micromonas
Micromonas micros: um dos principais componentes da microbiota do sulco gengival na doença periodontal. Pode estar presente no sulco gengival sadio.
Moraxella
Moraxella catarrhalis: hábitat é a língua, saliva e mucosa bucal.
Peptococcus
Peptococcus niger: isolados da microbiota bucal, podem estar associados com infecções bucais.
Peptostreptococcus micros: um dos principais componentes da microbiota do sulco gengival na doença periodontal.
Rothia 
Rothia denthocariosa: habitante de cavidade bucal e garganta humana. Encontrada em lesões de cárie avançada em dentina.
Streptococcus – são divididos em 6 grupos, dos quais quatro (mutans, anginosus, mitis e salivarius) são considerado estreptococos bucais.
Grupo mutans 
Streptococcus mutans: o hábitat primário é a superfície dos dentes, onde a colonização é favorecida por dieta rica em sacarose.
Streptococcus sobrinus: o hábitat é a superfície dentária humana, sendo cariogênico para animais experimentais; pode estar associado a cárie humana.
Grupo anginosus
Streptococcus anginosus, Streptococcus constellatus, Streptococcus intermedius: hábitat é a cavidade bucal humana, trato respiratório superior e vagina. Podem causar infecções purulentas.
Grupo mitis 
Streptococcus mitis, streptococcus oralis, streptococcus crista: hábitat é a cavidade bucal humana e orofaringe.
Grupo salivarius 
Streptococcus salivarius: associados à língua e à saliva.
Streptococcus vestibulares: hábitat é a cavidade bucal humana, principalmente a mucosa vestibular.
Bibliografia
Antonio Olavo Cardoso, Jorge; Microbiologia e Imunologia Oral 2° Tiragem – Microbiota Bucal Residente; 2012, Elsevier Editora Ltda.