Prévia do material em texto
06/06/2019 1 Quais são os riscos de um casal ter um filho com uma doença genética? As práticas de cruzamento na agricultura e na pecuária causaram perda da diversidade genética no âmbito da agroindústria? Essa perda implica em risco para nossa alimentação? As espécies silvestres, confinadas a áreas cada vez menores, serão capazes de evitar a extinção e sobreviver? População Grupo de indivíduos de uma mesma espécie que coexistem em uma área e tempo comuns e são capazes de se reproduzir e gerar descendentes viáveis e férteis. Genética de populações É a ciência que estuda as frequências gênicas, genotípicas e fenotípicas nas populações e as forças capazes de alterá-las ao longo das gerações. Portanto, a genética de populações analisa a quantidade e distribuição da variação genética nas populações e as forças que controlam essas variações. Genética Mendeliana Permite predizer a distribuição genotípica e o fenotípica da progênie resultante de um acasalamento. As leis de Mendel, embora expliquem como os genes são transmitidos dos genitores para a prole nos casos de cruzamentos controlados são insuficientes para entendermos a transmissão de genes de uma geração para a seguinte nas populações naturais, nas quais nem todos os indivíduos geram prole, nem toda a prole sobrevive. Genética de populações Permite predizer a distribuição genotípica e o fenotípica da progênie resultante de todos os acasalamentos possíveis na população. Estudando quais são os fenômenos e como eles afetam a estrutura genética de uma população ideal. Conceitos são aplicados em uma população real. 06/06/2019 2 O conhecimento da estrutura genética de uma população é indispensável ao melhorista para realizar sobre ela mudanças em magnitude e sentido desejado. A estrutura da população é definida pela frequência dos alelos que compõem os diferentes genótipos das diferentes famílias. Na genética de populações, um locus é simplesmente uma localização no genoma, podendo ser o sítio de um único nucleotídeo ou um segmento com muitos nucleotídeos. Com a descoberta dos SNPs, torna-se possível determinar o genótipo (composição alélica) de indivíduos diferentes na população para cada SNP. Geralmente trabalha-se com SNPs com dois alelos (Um SNP pode ter no máximo quatro alelos diferentes). Cada ponto (SNP) terá fluorescência vermelha para homozigoto, verde para o outro homozigoto e amarelo heterozigoto. Chip de DNA O número de alelos costuma ser bem grande (geralmente 20 ou mais). São abundantes na maioria dos genomas. Os humanos, por exemplo, possuem mais de um milhão de microssatélites. 06/06/2019 3 STR (Short Tandem Repeats) 2-9 pares de bases Podem se repetir de 4 a 100 vezes Variabilidade de sequência M IC R O S S A T É L IT E 4 nucleotídeos 8 repetições 7 repetições Microssatélites = STRs Como é a herança dos STRs ? Pool (conjunto) gênico é o somatório de todos os alelos nos membros reprodutivos de uma população em um determinado momento. Podemos descrever a variação em uma população em termos de frequências genotípicas e alélicas. GENÓTIPOS No. De indivíduos Frequência AA n1 D=n1/n Aa n2 H=n2/n aa n3 R=n3/n Total n 1,0 n = n1 + n2 + n3 D + H + R = 1,0 GENÓTIPOS No. De indivíduos Frequência AA 200 D=0,2 Aa 400 H=0,4 aa 400 R=0,4 Total 1000 1,0 06/06/2019 4 f(A) = p = (2n1 + n2)/2n = D + ½H f(a) = q = (2n3 + n2)/2n = R + ½H p + q = 1,0 GENÓTIPOS No. De indivíduos Frequência AA 200 D=0,2 Aa 400 H=0,4 aa 400 R=0,4 Total 1000 1,0 A partir destes valores, obtém-se: p = f(A) = 0,2 + ½ (0,4) = 0,4 q = f(a) = 0,4 + ½ (0.4) = 0,6 A frequência de um alelo no conjunto gênico é igual à probabilidade de que o alelo seja escolhido quando se capturar aleatoriamente um alelo do conjunto gênico para formar um ovócito ou um espermatozóide. Assim, no exemplo anterior, podemos calcular a probabilidade de um indivíduo na geração seguinte ser AA. p = f(A) = 0,2 + ½ (0,4) = 0,4 q = f(a) = 0,4 + ½ (0.4) = 0,6 Para ser formado um indivíduo AA na geração seguinte: A probabilidade do primeiro alelo ser A =p = 0,4. A probabilidade do segundo alelo ser A também é p=0,4. Indivíduo AA = pxp=0,4x04=0,16. No total, as frequências (f)genotípicas são: f(AA)=p2 f(aa)=q2 f(Aa)=2pq A soma da probabilidade de ser AA mais a probabilidade de ser Aa mais a probabilidade de ser aa é 1. p2 + 2pq + q2 =1 Lei de Hardy-Weinberg. Em uma população mendeliana, sob determinadas condições, as frequências gênicas permanecem constantes com o passar das gerações. 06/06/2019 5 Em uma população suficientemente grande e na ausência de seleção, migração e mutação, o equilíbrio é atingido após uma geração de acasalamento ao acaso ("aaa"), de tal maneira que a relação genotípica torna-se igual ao quadrado da freqüência gênica e, com as sucessivas gerações de acasalamento ao acaso, permanece inalterada. População mendeliana (população ideal) É infinita Reprodução sexuada Acasalamentos aleatórios (panmixia) Diplóide Número de fêmeas igual ao número de machos Todos os casais são férteis e têm o mesmo número de prole Sob a condição de NÃO sofrer: Seleção Mutação Migração Oscilação gênica Será considerada uma população original com genótipos AA, Aa e aa, nas frequências D, H e R, respectivamente. As frequências alélicas são p e q, para A e a, respectivamente. Considerando que ocorre acasalamento ao acaso ("aaa") entre os indivíduos desta população, pode-se predizer a descendência. Usamos para calcular as frequências genotípicas na geração seguinte a partir das frequências alélicas na geração atual. Calcular as frequências alélicas a partir das frequências genotípicas em uma única geração. f(A) = p1 = D + ½ H = p2 + ½ 2pq = p f(a) = q1 = R + ½ H = q2 + ½ 2pq = q A relação genotípica da descendência é dada por (pA + qa)² 06/06/2019 6 Um estudo de grande importância é avaliação da existência da condição de equilíbrio numa determinada população. Caso isto ocorra, é indicativo que a mesma não está sujeita à pressão de seleção, o fluxo de migração e a mutação são desprezíveis. Tendo-se informações sobre as frequências genotípicas, pode-se verificar as condições de equilíbrio. Sob a condição de panmixia, as frequências gênicas em qualquer geração são iguais às frequências gênicas iniciais. As frequências genotípicas nos descendentes, sob acasalamento ao acaso, dependem somente das frequências gênicas na geração parental e não da frequência genotípica Se na geração parental machos e fêmeas apresentam as mesmas frequências genotípicas, o equilíbrio é atingido em uma geração Mantidas as condições especificadas para o equilíbrio de H-W, as frequências gênicas e genotípicas permanecem constantes, geração após geração. Usando teste Qui-quadrado χ 2 Graus de liberdade: gl = nº genótipos – nº alelos = 3 – 2 = 1 Hipóteses: Ho: população está em equilíbrio de H-W H1: não está em equilíbrio de H-W GENÓTIPOS No. observado Frequência AA 100 0,6756 Aa 28 0,1891 aa 20 0,1351 Com os dados disponíveis, estimam-se as freqüência gênicas, como descrito a seguir: f(A) = p = D + ½ H =0,675 + ½ 0,1891 = 0,7701 f(a) = q = R + ½ H = 0,1351 + ½ 0,1891 = 0,2299 No equilíbrio espera-sea freqüência igual a p², para AA, 2pq para Aa e q² para aa, que corresponde a 0,5931 AA; 0,3537 Aa e 0,0527 aa GENÓTIPOS Observado Esperado no equilíbrio AA 100 87,78 Aa 28 52,35 aa 20 7,80 Como se dispõe de três classes fenotípicas, com valores esperados obtidos por meio das estimativas de p (ou de q), estima-se a estatística ², associada a 1 graus de liberdade. Para os dados considerados, tem- se: ² = [(100 - 87,78)²]/87,78 + [(28 - 52,35)²]/52,35 + [(20 - 7,80)²]/7,80 = 32,08 o valor de probabilidade associado é alfa = 0,0001. Conclui-se que os dados não se ajustam ao esperado sendo, portanto, indicativo de que a população não se encontra em equilíbrio.