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Pré e Pós Teste - Reação em Cadeia da Polimerase (PCR) 1 � Pré e Pós Teste - Reação em Cadeia da Polimerase (PCR) PRÉ TESTE 1. A técnica da reação em cadeia da polimerase (PCR), a mais utilizada para amplificação do DNA in vitro, revolucionou o acesso às informações genéticas. Com relação a essa técnica, assinale a opção correta. A. Na PCR, os primers (iniciadores) se hibridizam com moléculas de DNA dupla-fita separadas; B. Com a PCR, a enzima Taq polimerase é capaz de manter sua atividade mesmo nas altas temperaturas necessárias para desnaturar a molécula de DNA; C. A PCR também pode ser aplicada na análise de proteínas. 2. Considere que um projeto de pesquisa em biologia está sob análise, para que sejam constatadas sua viabilidade e a adequação dos recursos obtidos para sua realização. O projeto visa à expressão de determinado gene humano em um microrganismo e à purificação da proteína de interesse. A metodologia proposta para o desenvolvimento do projeto envolve reações catalisadas por DNA polimerases termoestáveis, na presença de oligonucleotídeos, utilizados como primers, e nucleotídeos livres, sendo realizadas em tubos de polipropileno. Depois de outras etapas, é proposta Pré e Pós Teste - Reação em Cadeia da Polimerase (PCR) 2 a inserção dos oligonucleotídeos amplificados em microrganismos e a ligação da proteína expressa a um anticorpo específico. Em relação às reações catalisadas pela DNA polimerase mencionadas no texto, assinale a opção correta. A. Para que as reações de amplificação possam ser concluídas, é imprescindível a adição de DNA ligase; B. A metodologia descrita no texto é compatível com a técnica de PCR; C. O texto permite concluir que as reações descrevem a clonagem de um cromossomo. 3. Por meio da PCR, uma sequência de DNA pode ser amplificada milhões ou bilhões de vezes, produzindo cópias suficientes de DNA para serem analisadas por outras técnicas, como o sequenciamento, ou digeridas por enzimas de restrição e clonadas em um plasmídeo. Existem recomendações específicas para a construção de primers, tais como: assegurar relação entre bases purinas e pirimidinas entre 40% e 60%; procurar sequência do primer com maior concentração de bases G/C na extremidade 5’ e menor concentração (um C ou um G) na porção 3’; evitar trincas de bases repetidas. Assinale a alternativa correta. A. Os primers devem ser complementares em sua composição, ou seja, deverá haver uma interação intermolecular entre eles; B. É necessário estabelecer o tamanho entre 10 e 15 bases de cada primer; C. É crucial que as temperaturas de anelamento dos dois primers sejam próximas. 4. A PCR é uma técnica com múltiplas aplicações na biologia molecular. A partir de uma molécula de DNA inicial, têm-se milhões de cópias do fragmento de DNA desejado. Em sua primeira etapa, ocorre a desnaturação da dupla-fita de DNA em fitas simples, pelo aumento da temperatura (95°C). Na Pré e Pós Teste - Reação em Cadeia da Polimerase (PCR) 3 segunda etapa, a temperatura é reduzida, para que os oligonucleotídeos (primers) se liguem às regiões complementares. Na terceira etapa, a enzima DNA polimerase reconhece os primers ligados e catalisa a polimerização das fitas, inserindo os nucleotídeos e formando novas fitas de DNA. Esse ciclo é repetido de 30 a 40 vezes, de forma que o fragmento de DNA é amplificado. Ao aumentar e reduzir a temperatura, as ligações entre as fitas da molécula de DNA são desfeitas e refeitas, respectivamente. Que tipo de ligação presente na molécula de DNA permite esse fenômeno? A. Ligação fosfodiéster; B. Ligação de hidrogênio; C. Ligação covalente. 5. Em exames clínicos, a técnica de amplificação de DNA pela PCR é muito utilizada. No diagnóstico de infecção de um paciente por um determinado vírus com genoma de DNA, por exemplo, a técnica permite a amplificação específica de material genético do vírus. O que garante a especificidade dessa reação? A. A DNA polimerase do próprio vírus, que amplifica a sequência do DNA viral; B. Os sais e nucleotídeos fosforilados do tampão empregado, que reconhecem o DNA viral; C. Os oligonucleotídeos iniciadores, complementares à sequência do DNA viral. PÓS TESTE 1. A técnica da reação em cadeia da polimerase (PCR) permitiu uma grande evolução na ciência e na medicina. Considerando Pré e Pós Teste - Reação em Cadeia da Polimerase (PCR) 4 a importância da PCR na ciência, assinale a alternativa correta. A. A técnica da PCR consiste em uma amplificação inespecífica utilizando um iniciador (primer) que limita o espaço a ser polimerizado pela Taq polimerase; B. A PCR consiste em uma ciclagem de temperaturas com o propósito de desnaturação, anelamento dos iniciadores e extensão pela DNA polimerase termoestável; C. O número de ciclos da PCR não é o limitante para amplificar o DNA pesquisado, pois a Taq polimerase consegue fazer milhares de cópias do fragmento gênico nos primeiros cinco ciclos da PCR. 2. A técnica da PCR é muito utilizada para identificação molecular, sendo voltada também para as áreas forenses. A respeito dessa utilização, assinale a alternativa correta. A. Apenas o DNA extraído de células vivas e tecidos saudáveis pode ser analisado por PCR, para fins de identificação molecular dentro da área das ciências forenses, excluindo o DNA de amostras mortas; B. Utilizando a PCR como método ouro de identificação molecular, peritos podem chegar a conclusões de crimes, por exemplo, amplificando uma região do DNA e comparando com uma amostra de um suspeito; C. As ciências forenses preferem utilizar metodologias voltadas para a identificação de proteínas, pois as sequências dos aminoácidos conseguem evidenciar e diferenciar indivíduos muito melhor do que as sequências nucleotídicas. 3. A PCR inclui um protocolo bem estabelecido, contendo reagentes essenciais para a catálise das reações. Com base em seus conhecimentos, assinale a alternativa que descreve por completo os reagentes necessários para a PCR. A. Taq DNA polimerase, DNA-molde, íons de magnésio e água; Pré e Pós Teste - Reação em Cadeia da Polimerase (PCR) 5 B. DNA-molde, íons de magnésio, água e iniciadores; C. Iniciadores, íons de magnésio, água, Taq DNA polimerase, DNA-molde e nucleotídeos livres. 4. A técnica da PCR é baseada em uma ciclagem de temperaturas específicas que determinam o sucesso da reação. Todo esse processo é altamente controlado e, se houver alguma mudança, erros catalíticos podem ocorrer. Com base em seus conhecimentos a respeito das ciclagens durante a PCR, assinale a alternativa correta. A. Existem três temperaturas diferentes na reação, sendo que a primeira requer a desnaturação do DNA, ocorrendo a 72 °C; B. Existem duas temperaturas diferentes na reação, ocorrendo a desnaturação do DNA a 95 °C e a polimerização a 72 °C; C. Existem três temperaturas diferentes na reação, sendo a primeira a 95 °C, com a desnaturação do DNA, a segunda ocorrendo normalmente, entre 55 °C e 60 °C, permitindo o anelamento dos iniciadores (primers), e a última a 72 °C, com a atividade de polimerização da Taq DNA polimerase. 5. A primeira versão publicada do genoma humano foi em 2003, graças ao sequenciamento do DNA e à PCR.A respeito de sua importância e técnica, assinale a alternativa correta. A. Os principais objetivos do projeto genoma humano consistiam em identificar todos os genes e mapeá-los nos cromossomos. Com isso, utilizou-se a PCR para analisar a variação genética entre humanos; B. As mutações podem ser identificadas pela PCR, discriminando o nível de bases nitrogenadas alteradas entre as amostras pesquisadas, como, por exemplo, as mutações que trocam os nucleotídeos; C. A facilidade de execução da PCR abre expectativas científicas para o conhecimento de genes de diversas espécies, como o coronavírus da pandemia de covid-19.